Luteoskyrin (T3D3768)
Record Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Creation Date | 2010-05-21 14:46:10 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Update Date | 2014-12-24 20:26:31 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession Number | T3D3768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Common Name | Luteoskyrin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Small Molecule | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | Luteoskyrin is a mycotoxin produced by the fungus Penicillium islandicum. It is known to be a storage mold contaminant of rice and has been shown to be hepatotoxic and hepatocarcinogenic. (3, 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Compound Type |
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Chemical Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms |
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Chemical Formula | C30H22O12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Average Molecular Mass | 574.489 g/mol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Monoisotopic Mass | 574.111 g/mol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CAS Registry Number | 21884-44-6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IUPAC Name | 5,8,10,14,20,23,25,28-octahydroxy-6,21-dimethyloctacyclo[14.11.1.0²,¹¹.0²,¹⁵.0⁴,⁹.0¹³,¹⁷.0¹⁷,²⁶.0¹⁹,²⁴]octacosa-4,6,8,10,19,21,23,25-octaene-3,12,18,27-tetrone | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Traditional Name | 5,8,10,14,20,23,25,28-octahydroxy-6,21-dimethyloctacyclo[14.11.1.0²,¹¹.0²,¹⁵.0⁴,⁹.0¹³,¹⁷.0¹⁷,²⁶.0¹⁹,²⁴]octacosa-4,6,8,10,19,21,23,25-octaene-3,12,18,27-tetrone | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMILES | CC1=CC(O)=C2C(O)=C3C(=O)C4C(O)C5C6C(O)C(C(=O)C7=C(O)C8=C(O)C=C(C)C(O)=C8C(=O)C467)C35C(=O)C2=C1O | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Identifier | InChI=1S/C30H22O12/c1-5-3-7(31)9-11(19(5)33)27(41)29-13-14-24(38)17(29)26(40)16-22(36)10-8(32)4-6(2)20(34)12(10)28(42)30(14,16)18(23(13)37)25(39)15(29)21(9)35/h3-4,13-14,17-18,23-24,31-38H,1-2H3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InChI Key | InChIKey=FAZDYVMEXQHRLI-UHFFFAOYSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Description | belongs to the class of organic compounds known as naphthols and derivatives. These are naphthalene derivatives carrying one or more hydroxyl (-OH) groups at any ring position. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Super Class | Benzenoids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Class | Naphthalenes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sub Class | Naphthols and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Direct Parent | Naphthols and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Alternative Parents | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Substituents |
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Molecular Framework | Aromatic homopolycyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Status | Detected and Not Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Origin | Exogenous | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Locations |
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Biofluid Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Applications | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Roles | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chemical Roles | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
State | Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Appearance | White powder. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental Properties |
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Predicted Properties |
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Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Spectra |
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Toxicity Profile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Route of Exposure | Oral, dermal, inhalation, and parenteral (contaminated drugs). (7) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mechanism of Toxicity | Luteoskyrin is hepatotoxic. It is thought that this is a result of its metabolic reduction to the semiquinone radical catalyzed by NADPH-dependent cytochrome reductases in the liver, leading to the generation of active oxygen species in redox systems. This causes the induction of lipid peroxidation, hepatocellular membrane damage, and elevation of serum transaminase activities, resultin in liver injuries. Luteoskyrin is also hepatocarcinogenic, possibly a result of its ability to induce DNA fragmentation. It is able to bind to DNA, forming chelate-complexes with nucleic acids and select metal ions. Luteoskyrin inhibits the replication, transcription and repair of DNA, which is at least partially because it inhibits RNA polymerase and ribonuclease H. (1, 2, 4, 5, 6) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Metabolism | Luteoskyrin accumulates selectively in the liver, with minor distribution to the serum and kidneys. In the liver it is reduced to its semiquinone radical by NADPH-dependent cytochrome reductases. (4, 5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Toxicity Values | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lethal Dose | 145 mg/kg subcutaneously and 221 mg/kg orally in mice. (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Carcinogenicity (IARC Classification) | 3, not classifiable as to its carcinogenicity to humans. (8) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uses/Sources | Luteoskyrin is a mycotoxin produced by the fungus Penicillium islandicum. It is known to be a storage mold contaminant of rice. (3) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Minimum Risk Level | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Health Effects | Luteoskyrin is hepatotoxic and hepatocarcinogenic, causing hepatic disorders such as liver cirrhosis and liver tumors. (3, 4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symptoms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Treatment | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Normal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Abnormal Concentrations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PubChem Compound ID | 30840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEMBL ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChemSpider ID | 28613 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CTD ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Stitch ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ACToR ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synthesis Reference | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MSDS | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
General References |
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Gene Regulation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Up-Regulated Genes | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Down-Regulated Genes | Not Available |
Targets
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Largest and catalytic core component of RNA polymerase I which synthesizes ribosomal RNA precursors. Forms the polymerase active center together with the second largest subunit. A single stranded DNA template strand of the promoter is positioned within the central active site cleft of Pol I. A bridging helix emanates from RPA1 and crosses the cleft near the catalytic site and is thought to promote translocation of Pol I by acting as a ratchet that moves the RNA-DNA hybrid through the active site by switching from straight to bent conformations at each step of nucleotide addition (By similarity).
- Gene Name:
- POLR1A
- Uniprot ID:
- O95602
- Molecular Weight:
- 194809.645 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
2. DNA
- General Function:
- Used for biological information storage.
- Specific Function:
- DNA contains the instructions needed for an organism to develop, survive and reproduce.
- Molecular Weight:
- 2.15 x 1012 Da
References
- Bouhet JC, Pham van Chuong P: Specific and non-specific interactions of two carcinogenic mycotoxins, luteoskyrin and rugulosin with nucleic acids. Ann Nutr Aliment. 1977;31(4-6):811-30. [566070 ]
- General Function:
- Ribonucleoside binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Second largest core component of RNA polymerase I which synthesizes ribosomal RNA precursors. Proposed to contribute to the polymerase catalytic activity and forms the polymerase active center together with the largest subunit. Pol I is composed of mobile elements and RPA2 is part of the core element with the central large cleft and probably a clamp element that moves to open and close the cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR1B
- Uniprot ID:
- Q9H9Y6
- Molecular Weight:
- 128228.39 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Poly(a) rna binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase I which synthesizes ribosomal RNA precursors. Isoform 1 is involved in UBTF-activated transcription, presumably at a step following PIC formation.Isoform 2 has been described as a component of preformed T-cell receptor (TCR) complex.
- Gene Name:
- CD3EAP
- Uniprot ID:
- O15446
- Molecular Weight:
- 54985.335 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase I which synthesizes ribosomal RNA precursors. Through its association with RRN3/TIF-IA may be involved in recruitment of Pol I to rDNA promoters.
- Gene Name:
- TWISTNB
- Uniprot ID:
- Q3B726
- Molecular Weight:
- 37432.025 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase I which synthesizes ribosomal RNA precursors. Appears to be involved in the formation of the initiation complex at the promoter by mediating the interaction between Pol I and UBTF/UBF (By similarity).
- Gene Name:
- POLR1E
- Uniprot ID:
- Q9GZS1
- Molecular Weight:
- 53961.43 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Ubiquitin protein ligase binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Largest and catalytic component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Forms the polymerase active center together with the second largest subunit. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB1 is part of the core element with the central large cleft, the clamp element that moves to open and close the cleft and the jaws that are thought to grab the incoming DNA template. At the start of transcription, a single-stranded DNA template strand of the promoter is positioned within the central active site cleft of Pol II. A bridging helix emanates from RPB1 and crosses the cleft near the catalytic site and is thought to promote translocation of Pol II by acting as a ratchet that moves the RNA-DNA hybrid through the active site by switching from straight to bent conformations at each step of nucleotide addition. During transcription elongation, Pol II moves on the template as the transcript elongates. Elongation is influenced by the phosphorylation status of the C-terminal domain (CTD) of Pol II largest subunit (RPB1), which serves as a platform for assembly of factors that regulate transcription initiation, elongation, termination and mRNA processing. Acts as an RNA-dependent RNA polymerase when associated with small delta antigen of Hepatitis delta virus, acting both as a replicate and transcriptase for the viral RNA circular genome.
- Gene Name:
- POLR2A
- Uniprot ID:
- P24928
- Molecular Weight:
- 217174.235 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Lrr domain binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB11 is part of the core element with the central large cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2J
- Uniprot ID:
- P52435
- Molecular Weight:
- 13293.19 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB11 is part of the core element with the central large cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2J2
- Uniprot ID:
- Q9GZM3
- Molecular Weight:
- 13088.14 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB11 is part of the core element with the central large cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2J3
- Uniprot ID:
- Q9H1A7
- Molecular Weight:
- 13092.11 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Ribonucleoside binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Second largest component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Proposed to contribute to the polymerase catalytic activity and forms the polymerase active center together with the largest subunit. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB2 is part of the core element with the central large cleft, the clamp element that moves to open and close the cleft and the jaws that are thought to grab the incoming DNA template (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2B
- Uniprot ID:
- P30876
- Molecular Weight:
- 133895.435 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB3 is part of the core element with the central large cleft and the clamp element that moves to open and close the cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2C
- Uniprot ID:
- P19387
- Molecular Weight:
- 31440.86 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Translation initiation factor binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB4 is part of a subcomplex with RPB7 that binds to a pocket formed by RPB1, RPB2 and RPB6 at the base of the clamp element. The RBP4-RPB7 subcomplex seems to lock the clamp via RPB7 in the closed conformation thus preventing double-stranded DNA to enter the active site cleft. The RPB4-RPB7 subcomplex binds single-stranded DNA and RNA (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2D
- Uniprot ID:
- O15514
- Molecular Weight:
- 16311.105 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Translation initiation factor binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB7 is part of a subcomplex with RPB4 that binds to a pocket formed by RPB1, RPB2 and RPB6 at the base of the clamp element. The RBP4-RPB7 subcomplex seems to lock the clamp via RPB7 in the closed conformation thus preventing double-stranded DNA to enter the active site cleft. The RPB4-RPB7 subcomplex binds single-stranded DNA and RNA (By similarity). Binds RNA.
- Gene Name:
- POLR2G
- Uniprot ID:
- P62487
- Molecular Weight:
- 19294.195 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Component of RNA polymerase II which synthesizes mRNA precursors and many functional non-coding RNAs. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. It is composed of mobile elements that move relative to each other. RPB9 is part of the upper jaw surrounding the central large cleft and thought to grab the incoming DNA template (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2I
- Uniprot ID:
- P36954
- Molecular Weight:
- 14523.1 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I and III which synthesize ribosomal RNA precursors and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively. RPAC1 is part of the Pol core element with the central large cleft and probably a clamp element that moves to open and close the cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR1C
- Uniprot ID:
- O15160
- Molecular Weight:
- 39249.375 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common core component of RNA polymerases I and III which synthesize ribosomal RNA precursors and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively.
- Gene Name:
- POLR1D
- Uniprot ID:
- Q9Y2S0
- Molecular Weight:
- 15237.11 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. Pols are composed of mobile elements that move relative to each other. In Pol II, POLR2E/RPB5 is part of the lower jaw surrounding the central large cleft and thought to grab the incoming DNA template. Seems to be the major component in this process (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2E
- Uniprot ID:
- P19388
- Molecular Weight:
- 24551.075 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerases catalyze the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II, and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. Pols are composed of mobile elements that move relative to each other. In Pol II, POLR2F/RPB6 is part of the clamp element and together with parts of RPB1 and RPB2 forms a pocket to which the RPB4-RPB7 subcomplex binds (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2F
- Uniprot ID:
- P61218
- Molecular Weight:
- 14477.92 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Dna-directed rna polymerase activity
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively.
- Gene Name:
- POLR2H
- Uniprot ID:
- P52434
- Molecular Weight:
- 17143.115 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and a small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively.
- Gene Name:
- POLR2K
- Uniprot ID:
- P53803
- Molecular Weight:
- 7004.145 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- DNA-dependent RNA polymerase catalyzes the transcription of DNA into RNA using the four ribonucleoside triphosphates as substrates. Common component of RNA polymerases I, II and III which synthesize ribosomal RNA precursors, mRNA precursors and many functional non-coding RNAs, and a small RNAs, such as 5S rRNA and tRNAs, respectively. Pol II is the central component of the basal RNA polymerase II transcription machinery. Pols are composed of mobile elements that move relative to each other. In Pol II, POLR2L/RBP10 is part of the core element with the central large cleft (By similarity).
- Gene Name:
- POLR2L
- Uniprot ID:
- P62875
- Molecular Weight:
- 7645.02 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Rna-dna hybrid ribonuclease activity
- Specific Function:
- Endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA-DNA hybrids (PubMed:10497183). Plays a role in RNA polymerase II (RNAp II) transcription termination by degrading R-loop RNA-DNA hybrid formation at G-rich pause sites located downstream of the poly(A) site and behind the elongating RNAp II (PubMed:21700224).
- Gene Name:
- RNASEH1
- Uniprot ID:
- O60930
- Molecular Weight:
- 32064.035 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Rna-dna hybrid ribonuclease activity
- Specific Function:
- Catalytic subunit of RNase HII, an endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA:DNA hybrids. Participates in DNA replication, possibly by mediating the removal of lagging-strand Okazaki fragment RNA primers during DNA replication. Mediates the excision of single ribonucleotides from DNA:RNA duplexes.
- Gene Name:
- RNASEH2A
- Uniprot ID:
- O75792
- Molecular Weight:
- 33394.58 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Rna-dna hybrid ribonuclease activity
- Specific Function:
- Non catalytic subunit of RNase H2, an endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA:DNA hybrids. Participates in DNA replication, possibly by mediating the removal of lagging-strand Okazaki fragment RNA primers during DNA replication. Mediates the excision of single ribonucleotides from DNA:RNA duplexes.
- Gene Name:
- RNASEH2B
- Uniprot ID:
- Q5TBB1
- Molecular Weight:
- 35138.455 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]
- General Function:
- Rna-dna hybrid ribonuclease activity
- Specific Function:
- Non catalytic subunit of RNase H2, an endonuclease that specifically degrades the RNA of RNA:DNA hybrids. Participates in DNA replication, possibly by mediating the removal of lagging-strand Okazaki fragment RNA primers during DNA replication. Mediates the excision of single ribonucleotides from DNA:RNA duplexes.
- Gene Name:
- RNASEH2C
- Uniprot ID:
- Q8TDP1
- Molecular Weight:
- 17839.985 Da
References
- Tashiro F, Hiral K, Ueno Y: Inhibitory effects of carcinogenic mycotoxins on deoxyribonucleic acid-dependent ribonucleic acid polymerase and ribonuclease H. Appl Environ Microbiol. 1979 Aug;38(2):191-6. [117749 ]