Diclofop-methyl (T3D3824)
| Record Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Version | 2.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2013-04-25 07:56:51 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2014-12-24 20:26:33 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Accession Number | T3D3824 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Diclofop-methyl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Small Molecule | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Diclofop-methyl is a polycyclic alkanoic acid herbicide. Diclofop-methyl undergoes hydrolysis to form diclofop-acid a compound that also exhibits herbicidal properties. Diclofop-methyl was registered in Canada in 1977 and is sold under the tradename Hoe-Grass. Diclofop-methyl is used for postemergence control of wild oats, wild millets, and other annual grass weeds in wheat, barley, rye, red fescue, and broad-leaved crops such as soya beans, sugar beet, flax, legumes, potatoes, and cucumbers. Diclofop-methyl is a selective systemic herbicide that is used primarily in the prairies. It destroys the cell membrane, prevents the translocation of assimilates to the roots, reduces the chlorophyll content, and inhibits photosynthesis and meristem activity. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compound Type |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Structure |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Formula | C16H14Cl2O4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Molecular Mass | 341.186 g/mol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 340.027 g/mol | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | 51338-27-3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | methyl 2-[4-(2,4-dichlorophenoxy)phenoxy]propanoate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | diclofop methyl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | COC(=O)C(C)OC1=CC=C(OC2=CC=C(Cl)C=C2Cl)C=C1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C16H14Cl2O4/c1-10(16(19)20-2)21-12-4-6-13(7-5-12)22-15-8-3-11(17)9-14(15)18/h3-10H,1-2H3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | InChIKey=BACHBFVBHLGWSL-UHFFFAOYSA-N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | belongs to the class of organic compounds known as diphenylethers. These are aromatic compounds containing two benzene rings linked to each other through an ether group. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Benzenoids | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Benzene and substituted derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Diphenylethers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Diphenylethers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Substituents |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Framework | Aromatic homomonocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Not Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Origin | Exogenous | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biofluid Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Applications | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Roles | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Roles | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Appearance | White powder. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Spectra |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Toxicity Profile | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Route of Exposure | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mechanism of Toxicity | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolism | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Toxicity Values | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Lethal Dose | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Carcinogenicity (IARC Classification) | No indication of carcinogenicity to humans (not listed by IARC). | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Uses/Sources | This is a man-made compound that is used as a pesticide. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Minimum Risk Level | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Health Effects | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symptoms | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Treatment | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Normal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Abnormal Concentrations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound ID | 39985 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL ID | CHEMBL34474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChemSpider ID | 36557 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG ID | C11021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniProt ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMIM ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Stitch ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ACToR ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synthesis Reference | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MSDS | T3D3824.pdf | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Regulation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Up-Regulated Genes | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Down-Regulated Genes | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Targets
- General Function:
- Not Available
- Specific Function:
- Not Available
- Gene Name:
- CCL2
- Uniprot ID:
- P13500
- Molecular Weight:
- 11024.87 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.48 uM | BSK_SM3C_MCP1_up | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Platelet-derived growth factor binding
- Specific Function:
- Collagen type III occurs in most soft connective tissues along with type I collagen. Involved in regulation of cortical development. Is the major ligand of GPR56 in the developing brain and binding to GPR56 inhibits neuronal migration and activates the RhoA pathway by coupling GPR56 to GNA13 and possibly GNA12.
- Gene Name:
- COL3A1
- Uniprot ID:
- P02461
- Molecular Weight:
- 138564.005 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.48 uM | BSK_hDFCGF_CollagenIII_down | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Ubiquitin protein ligase binding
- Specific Function:
- Receptor tyrosine kinase binding ligands of the EGF family and activating several signaling cascades to convert extracellular cues into appropriate cellular responses. Known ligands include EGF, TGFA/TGF-alpha, amphiregulin, epigen/EPGN, BTC/betacellulin, epiregulin/EREG and HBEGF/heparin-binding EGF. Ligand binding triggers receptor homo- and/or heterodimerization and autophosphorylation on key cytoplasmic residues. The phosphorylated receptor recruits adapter proteins like GRB2 which in turn activates complex downstream signaling cascades. Activates at least 4 major downstream signaling cascades including the RAS-RAF-MEK-ERK, PI3 kinase-AKT, PLCgamma-PKC and STATs modules. May also activate the NF-kappa-B signaling cascade. Also directly phosphorylates other proteins like RGS16, activating its GTPase activity and probably coupling the EGF receptor signaling to the G protein-coupled receptor signaling. Also phosphorylates MUC1 and increases its interaction with SRC and CTNNB1/beta-catenin.Isoform 2 may act as an antagonist of EGF action.
- Gene Name:
- EGFR
- Uniprot ID:
- P00533
- Molecular Weight:
- 134276.185 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.48 uM | BSK_hDFCGF_EGFR_down | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Serine-type endopeptidase inhibitor activity
- Specific Function:
- Serine protease inhibitor. This inhibitor acts as 'bait' for tissue plasminogen activator, urokinase, protein C and matriptase-3/TMPRSS7. Its rapid interaction with PLAT may function as a major control point in the regulation of fibrinolysis.
- Gene Name:
- SERPINE1
- Uniprot ID:
- P05121
- Molecular Weight:
- 45059.695 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.48 uM | BSK_hDFCGF_PAI1_down | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Serine-type endopeptidase activity
- Specific Function:
- Specifically cleaves the zymogen plasminogen to form the active enzyme plasmin.
- Gene Name:
- PLAU
- Uniprot ID:
- P00749
- Molecular Weight:
- 48507.09 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 1.48 uM | BSK_BE3C_uPA_down | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Zinc ion binding
- Specific Function:
- Nuclear receptor that binds and is activated by variety of endogenous and xenobiotic compounds. Transcription factor that activates the transcription of multiple genes involved in the metabolism and secretion of potentially harmful xenobiotics, drugs and endogenous compounds. Activated by the antibiotic rifampicin and various plant metabolites, such as hyperforin, guggulipid, colupulone, and isoflavones. Response to specific ligands is species-specific. Activated by naturally occurring steroids, such as pregnenolone and progesterone. Binds to a response element in the promoters of the CYP3A4 and ABCB1/MDR1 genes.
- Gene Name:
- NR1I2
- Uniprot ID:
- O75469
- Molecular Weight:
- 49761.245 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 4.41 uM | NVS_NR_hPXR | Novascreen |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Interleukin-8 receptor binding
- Specific Function:
- IL-8 is a chemotactic factor that attracts neutrophils, basophils, and T-cells, but not monocytes. It is also involved in neutrophil activation. It is released from several cell types in response to an inflammatory stimulus. IL-8(6-77) has a 5-10-fold higher activity on neutrophil activation, IL-8(5-77) has increased activity on neutrophil activation and IL-8(7-77) has a higher affinity to receptors CXCR1 and CXCR2 as compared to IL-8(1-77), respectively.
- Gene Name:
- CXCL8
- Uniprot ID:
- P10145
- Molecular Weight:
- 11097.98 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 4.44 uM | BSK_hDFCGF_IL8_up | BioSeek |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Steroid hydroxylase activity
- Specific Function:
- Cytochromes P450 are a group of heme-thiolate monooxygenases. In liver microsomes, this enzyme is involved in an NADPH-dependent electron transport pathway. It oxidizes a variety of structurally unrelated compounds, including steroids, fatty acids, and xenobiotics. Acts as a 1,4-cineole 2-exo-monooxygenase.
- Gene Name:
- CYP2B6
- Uniprot ID:
- P20813
- Molecular Weight:
- 56277.81 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 9.07 uM | CLZD_CYP2B6_6 | CellzDirect |
| AC50 | 4.45 uM | CLZD_CYP2B6_24 | CellzDirect |
| AC50 | 6.55 uM | CLZD_CYP2B6_48 | CellzDirect |
| AC50 | 5.51 uM | CLZD_CYP2B6_48 | CellzDirect |
| AC50 | 6.30 uM | CLZD_CYP2B6_6 | CellzDirect |
| AC50 | 5.18 uM | CLZD_CYP2B6_24 | CellzDirect |
| AC50 | 5.04 uM | CLZD_CYP2B6_48 | CellzDirect |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Hydroxymethylglutaryl-coa synthase activity
- Specific Function:
- This enzyme condenses acetyl-CoA with acetoacetyl-CoA to form HMG-CoA, which is the substrate for HMG-CoA reductase.
- Gene Name:
- HMGCS2
- Uniprot ID:
- P54868
- Molecular Weight:
- 56634.915 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 5.14 uM | CLZD_HMGCS2_6 | CellzDirect |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Steroid hydroxylase activity
- Specific Function:
- Responsible for the metabolism of a number of therapeutic agents such as the anticonvulsant drug S-mephenytoin, omeprazole, proguanil, certain barbiturates, diazepam, propranolol, citalopram and imipramine.
- Gene Name:
- CYP2C19
- Uniprot ID:
- P33261
- Molecular Weight:
- 55930.545 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 5.96 uM | NVS_ADME_hCYP2C19 | Novascreen |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]
- General Function:
- Steroid hydroxylase activity
- Specific Function:
- Cytochromes P450 are a group of heme-thiolate monooxygenases. In liver microsomes, this enzyme is involved in an NADPH-dependent electron transport pathway. It oxidizes a variety of structurally unrelated compounds, including steroids, fatty acids, and xenobiotics. This enzyme contributes to the wide pharmacokinetics variability of the metabolism of drugs such as S-warfarin, diclofenac, phenytoin, tolbutamide and losartan.
- Gene Name:
- CYP2C9
- Uniprot ID:
- P11712
- Molecular Weight:
- 55627.365 Da
Binding/Activity Constants
| Type | Value | Assay Type | Assay Source |
|---|---|---|---|
| AC50 | 8.18 uM | CLZD_CYP2C9_48 | CellzDirect |
References
- Sipes NS, Martin MT, Kothiya P, Reif DM, Judson RS, Richard AM, Houck KA, Dix DJ, Kavlock RJ, Knudsen TB: Profiling 976 ToxCast chemicals across 331 enzymatic and receptor signaling assays. Chem Res Toxicol. 2013 Jun 17;26(6):878-95. doi: 10.1021/tx400021f. Epub 2013 May 16. [23611293 ]